June 5, 2011

用Google Spreadsheet批量生成化学信息和结构图片

 手里有一串CAS或者化学名列表（十有八九是存在Excel里的），想补全其他化学基本信息包括结构式图片，现在已经有一些Excel的插件能用了，不过在Google Spreadsheet里做这件事真是格外感到荡气回肠…

所有的原理、代码、操作指南都是从 http://metamolecular.com/gchem/ 这里学来的。

实验过程全程翻墙。

基本的原理是

  • 有一个Web Service能完成化学方面的事情。这里用的是著名的 http://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure
  • Google Spreadsheet能执行自定义的脚本(javascript)；而且脚本里还能用UrlFetchApp.fetch(url)这种去访问网页或Web Service！

脚本安装和使用的过程 http://metamolecular.com/blog/2011/02/22/gchem-easily-convert-names-and-cas-numbers-to-chemical-structures-in-google-spreadsheets/

效果

其他

  • 表格导出Excel文件时自定义脚本都失效了；保存成PDF图都没了。
  • 再加上现在国内墙越弄越nb，恐怕没法作为常用工具去用。
  • 比较容易可以更换成自己写的Web Service，比之现在查到的内容更精准有效。

 

* Filed by charlie at 11:39 pm under chemoinformatics,Tools
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