May 30, 2011

MIOSS 2011资料下载

多谢chemhack同学给的链接，下载到了的所有演讲资料。

https://registration.hinxton.wellcome.ac.uk/display_info.asp?id=246

必须得说，资料里面很有料；也必须得说，大部分都没看懂。

大致有感觉的是，开源的意思就是开放，开放的意思就是融合，所以一干工具的组合很有意思

  化学信息软件 数据处理/数据挖掘/流程控制 关系数据库
Gregory Landrum RDKit Knime PostgreSQL
Rajarshi Guha CDK R  
Kevin Lawson, LICSS System CDK MS Excel  
Dr Katy Wolstencroft CDK Taverna  
Thorsten Meinl RDKit, Indigo Knime  

事实上现在存在的工具的组合远不止于此，比如历史悠久的mychem=openbabel+mysql。搞开源的人耻于鼓捣微软的平台（鼓捣苹果就高雅了？），所以自己还是需要再做功课，争取能做一点贡献。

* Filed by charlie at 11:13 pm under chemoinformatics,datamining,Tools
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May 27, 2011

Evernote VS. TiddlyWiki

 电子笔记是我深度依赖的工具，Evernote和TiddlyWiki各有千秋，不好抉择啊。

  TW EN 对Charlie重要
条目间引用 Wiki风格，用[[...]]很方便 无 *, TW胜
TAG OK，且TAG自身也是一个条目 OK  
表格 比较复杂，用字符控制，但效果不错，表头、单元格合并等都能很好表现。不能从别处粘贴。 能粘贴，能可视化编辑，效果比较弱。  
图片和附件 文件单独存放，不方便。 能粘贴。有屏幕截图功能，非常方便。 *, EN胜
格式 强，掌握控制字符，加上CSS几乎为所欲为。 弱，连H1/H2…都不支持。 *, TW胜
筛选 OK OK，有“属性”的功能；可以使用tag组合筛选；可以保存自定义筛选条件。 *, EN胜
备份和同步 单一文件，可以通过快盘、Dropbox来同步。不能在网上编辑，必须下载到本地再上传回去。不能解决冲突。 有服务器支持，网上编辑和冲突处理都非常好。 *, EN胜
客户端 浏览器即可。 专门客户端，也在网站上直接浏览和编辑。  
平台 理论上不限平台，但不是所有的平台上的浏览器都能支持本地保存HTML。 Linux下没有官方客户端，可用Nevernote。主流智能手机操作系统有客户端，可以搞拍照上传。支持IPAD。 *, EN胜
可定制性 强。可以自己充分DIY，也有很多插件。 无 *, TW胜
文档版本 无 有，需要升级。  
GTD checkboxPlugin，挺好用了。 属性>包括>未完成待办事项条目，  
其他   * 邮件接收（充分折腾后暴强大）
* 手写，OCR
* Chrome等浏览器插件		  

 

* Filed by charlie at 6:50 am under Tools
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May 22, 2011

第6千万个CAS注册的化合物

 原文：

主要的意思

  1. 第6千万个CAS注册的化合物，是一个中国的专利，CAS号是1298016-92-8。
  2. 从2009年开始，在新化合物的专利注册上，中国就超过其他国家，估计这种领先优势将一直保持下去。
  3. 第5千万个化合物是不到两年之前注册的，而且速度还在不断加快。这样算起来的话，每天平均有几万个新的CAS注册化合物，不得了，我有些怀疑Chemical Abstracts Service (CAS)的工作质量。

 

* Filed by charlie at 9:04 pm under chemoinformatics
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