Charlie’s path to dEAth

ChemDeposit是在Google Appengine (java) 上运行的化合物信息生成、存储、检索的服务。

在6月15号，就已经发布上去能工作的版本了，不过不能支持子结构检索，只能用指纹散列（fingerprint）做“近似子结构检索）。

为了调整CDK的版本，增加子结构检索(SMARTS Searching)，竟然用了一周的时间，遇到好多小问题。最难办的就是在客户机的SDK上运行OK，上传上去就不行的问题。最最难办的就是数据结构修改后，原有的数据成为非法数据删不掉的情况。

相关的问题和解决的过程在这里。

Jun 20, 2009

Version 3.

• Using CDK jar version 1.2.3
• Substructure Searching supported. That means the CDK SMARTS searching function works.
• Similar Structure Searching (Tanimoto) supported.
• Has a domain name www.chemdeposit.com

Filed by charlie at 10:56 pm under ChemDeposit, chemoinformatics